Volvió a la acción el 18 de noviembre en una victoria por 4-1 sobre el Newcastle United, camiseta dela juventus ayudando a Anthony Martial con un centro desde el costado y anotó el tercer gol del United. El 24 de septiembre marco su primer gol en la victoria 4 a 1 sobre el Leicester City. Su primer doblete lo haría el 20 de octubre en la victoria 4 a 1 contra el Fenerbahçe por la Liga Europa de la UEFA 2016-17. El mánager José Mourinho defendió a Pogba después del partido, criticando a los «Einsteins» del fútbol por ser demasiado rápidos para juzgar al jugador.